El presente grupo de investigación se enfoca en el estudio integral de los mecanismos moleculares y genómicos que subyacen a la resistencia antimicrobiana en los patógenos prioritarios del grupo SKAPE(Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterococcus spp.) y otros microorganismos de relevancia clínica según la Organización Mundial de la Salud (OMS). Mediante un enfoque multidisciplinario que combina técnicas de biología molecular avanzada y secuenciación de nanoporos (Oxford Nanopore Technologies), se busca elucidar los determinantes genéticos de resistencia, su dispersión epidemiológica y su impacto en la salud pública.

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Objetivos Específicos:

1. Caracterización molecular de perfiles de resistencia:

   • Detección y cuantificación de genes de resistencia críticos (blaKPC, blaNDM, mecA, vanA) mediante PCR en tiempo real (qPCR) y multiplex PCR.

   • Identificación de mecanismos emergentes de resistencia mediante secuenciación completa del genoma (Whole Genome Sequencing, WGS).

2. Análisis genómico de alta resolución:

   • Secuenciación en tiempo real con plataformas MinION (Oxford Nanopore) para:

     • Determinar la arquitectura genómica de plásmidos, transposones e integrones asociados a la diseminación horizontal de resistencia.

     • Estudiar la dinámica evolutiva de clones bacterianos resistentes mediante análisis filogenómico.

   • Integración de herramientas bioinformáticas (EPI2ME, CARD, ResFinder) para el análisis de variantes genéticas y predicción de resistencias.

3. Correlación genotipo-fenotipo:

   • Validación funcional de marcadores genéticos mediante ensayos de susceptibilidad antimicrobiana (CLSI/EUCAST) y modelos de infección in vitro.

   • Evaluación de la expresión génica diferencial asociada a resistencia mediante RT-qPCR y transcriptómica.

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Además, la búsqueda de fármacos que contribuyan a nuevas terapias las cuales ayuden al tratamiento de las enfermedades hepáticas son nuestras principales lineas de investigación.​

Los principales modelos de estudio son: ​

1.- Modelos murinos de fibrosis y cirrosis. 

2.- Modelos murinos de hepatocarcinogénesis.

3.- Modelos murinos de hígado graso.